主要功能用途
Applied Biosystems QuantStudio 7 Pro、QuantStudio 7 Flex實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀借助于PCR反應(yīng)體系中加入的熒光基團(tuán),可實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)PCR全過(guò)程累積的熒光信號(hào),通過(guò)熒光信號(hào)的分析對(duì)比分析,實(shí)現(xiàn)準(zhǔn)確可靠地定性、相對(duì)定量和絕對(duì)定量分析。
主要應(yīng)用功能包括:
1、基因表達(dá)分析
動(dòng)植物和微生物在生理病理、環(huán)境及外來(lái)脅迫下相關(guān)基因表達(dá)的變化分析以及SiRNA誘導(dǎo)基因沉默和基因敲除后特定基因表達(dá)水平的檢測(cè)。
2、miRNA表達(dá)水平的檢測(cè)
基于miRNA與特定靶基因mRNA表達(dá)水平變化間的關(guān)聯(lián),研究miRNA 調(diào)控基因表達(dá)機(jī)制。
3、基因分型(SNP genotyping,Genotyping)
利用TaqMan探針、飽和DNA染料HRM曲線分析進(jìn)行基因分型,得出等位基因頻率、基因型占總基因型比率等。可應(yīng)用于如遺傳病診斷,SNP基因分型,藥物代謝酶DME基因分型,法醫(yī)遺傳學(xué)鑒定等。
4、拷貝數(shù)變異(CNV)
拷貝數(shù)變異(Copy number variation, CNV)是指因基因組發(fā)生重排而導(dǎo)致長(zhǎng)度1KB以上的基因片段的缺失(減少)、插入、重復(fù)(增加)、重排、倒 位、DNA 拷貝數(shù)目變化,也稱為拷貝數(shù)多態(tài)性(copy number polymorphisms, CNPs)。是造成物種個(gè)體差異和人類許多疾病(如癌癥、遺傳性疾病、心血管疾病)的一種重要遺傳基礎(chǔ)。熒光實(shí)時(shí)定量PCR檢測(cè)初始樣品的某個(gè)DNA 片段的拷貝數(shù)進(jìn)行定量,用已知拷貝數(shù)為2的DNA內(nèi)參校正而實(shí)現(xiàn)對(duì)目DNA 片段拷貝數(shù)的確認(rèn)。
5、高分辨率溶解曲線分析(High resolution melt, HRM)
DNA序列長(zhǎng)度、GC 含量及堿基互補(bǔ)性差異影響DNA雙鏈結(jié)構(gòu)的熱穩(wěn)定性。高分辨熔解曲線(high-resolution melt,HRM) 分析是通過(guò)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)升溫過(guò)程中與雙鏈DNA特異性結(jié)合的熒光染料釋放的綠色熒光強(qiáng)度的變化,了解PCR 產(chǎn)物中DNA分子的解鏈溫度情況,分析樣品特定基因片段DNA組成變化。實(shí)時(shí)熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)運(yùn)行程序中引入溶解曲線分析環(huán)節(jié)后,可借助于專用HRM分析模塊完成HRM分析。HRM用于突變掃描和基因分型,不受突變堿基位點(diǎn)和種類限制,既可對(duì)未知突變進(jìn)行篩查、掃描,又能對(duì)已知突變進(jìn)行分析,還可用于STR分析。
6、病原體檢測(cè)(Pathogen detection)
實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀能可靠用于臨床醫(yī)學(xué)人體上呼吸道的感染、肺炎、消化道感染、中樞神經(jīng)系統(tǒng)等疾病,以及畜牧業(yè)、農(nóng)作物病蟲(chóng)害的病原體的檢測(cè)確認(rèn)、感染嚴(yán)重程度的量化評(píng)估。
7、蛋白熱漂移分析(Protein thermal shift)
利用實(shí)時(shí)定量PCR儀來(lái)分析熱穩(wěn)定性,進(jìn)行配體-蛋白結(jié)合的高通量篩選,突變或修飾對(duì)蛋白熱穩(wěn)定性的影響
使用蛋白結(jié)合染料(如Protein Thermal Shift 染料),實(shí)時(shí)定量PCR系統(tǒng)上運(yùn)行實(shí)時(shí)熔解實(shí)驗(yàn),根據(jù)因蛋白熔解導(dǎo)致熒光圖像差異,分析配體與蛋白的結(jié)合穩(wěn)定性。可用于以高通量篩選配體與蛋白的結(jié)合, 篩選能與蛋白靶點(diǎn)結(jié)合的小分子和片段文庫(kù)候選藥物、抗體,鑒定最佳緩沖液條件以改善蛋白的純化和分離等。
8、食品安全和GMO(genetically modified organism)檢測(cè)
實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)用于食品的微生物污染監(jiān)測(cè)、肉食類食品食材來(lái)源和組成的檢驗(yàn)、如轉(zhuǎn)基因動(dòng)植物基因的檢測(cè)等。
9、耐藥基因檢測(cè)等
性能特點(diǎn)
Applied Biosystems QuantStutio 7 Pro、QuantStudio 7 Flex實(shí)時(shí)熒光定量 PCR儀具有簡(jiǎn)化易用的工作流程、直觀應(yīng)用軟件和大型觸摸屏界面。可以直接在觸摸屏上實(shí)施實(shí)驗(yàn)參數(shù)設(shè)置、啟動(dòng)和運(yùn)行監(jiān)控和實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)分析。數(shù)據(jù)分析程序可將多個(gè)數(shù)據(jù)集整合在一處并以數(shù)據(jù)可視化形式呈現(xiàn)和分析。
1、樣品反應(yīng)模塊可互換
與QuantStutio 1/3/5只能運(yùn)行單一樣品模塊不同,QuantStutio 7 Pro、QuantStudio 7 Flex可運(yùn)行標(biāo)準(zhǔn)96×0.2 mL、快速96×0.1 mL、高通量384孔和TaqMan陣列卡(TAC)檢測(cè)模塊共4種反應(yīng)模塊。
TaqMan 陣列卡使用很少的樣品量,在10分鐘內(nèi)只需8個(gè)移液步驟即可加載多達(dá)384個(gè)靶標(biāo)。
模塊更換極其簡(jiǎn)便:只需按下按鈕或使用語(yǔ)音命令,即在96孔(0.1和0.2 mL)、384孔和 TaqMan 陣列卡間輕松切換。
2、多重?zé)晒舛糠治?/p>
QuantStudio 7 Pro、QuantStudio 7 Flex實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀的OptiFlex光學(xué)檢測(cè)系統(tǒng),采用寬光譜、高強(qiáng)度白色LED光源,發(fā)射波長(zhǎng)范圍寬,完美勝任最多6重實(shí)時(shí)熒光定量分析(Multiplex qPCR)應(yīng)用。
3、實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)規(guī)范化
QuantStudio 7 Pro、QuantStudio 7 Flex實(shí)行用戶賬戶管理控制,可建立標(biāo)準(zhǔn)化的實(shí)驗(yàn)協(xié)議和調(diào)用實(shí)驗(yàn)?zāi)0妫峁┓螹IQE指南要求的實(shí)時(shí)數(shù)據(jù)標(biāo)記語(yǔ)言(Real-Time Data Mark-Up Language,RDML)導(dǎo)出功能。
與QuantStudio 7 Flex比, QuantStudio 7 Pro還具有以下4-6項(xiàng)新型功能。
4、VeriFlex多溫度梯度控制模塊
QuantStutio 7 Pro采用 VeriFlex溫控模塊,能在同一次運(yùn)行中運(yùn)行6種不同引物退火溫度,便于反應(yīng)條件的優(yōu)化(QuantStudio 7 Flex為普通等溫樣品模塊)。
5、智能操作功能
QuantStutio 7 Pro支持智能功能,可以通過(guò)面部認(rèn)證和語(yǔ)音命令(如open Pro instrument, Change block等)免提操作,快速訪問(wèn)個(gè)人實(shí)驗(yàn)?zāi)0搴唾Y料。
智能幫助(Smart Help)允許用戶直接從觸摸屏直接聯(lián)系技術(shù)支持。由經(jīng)驗(yàn)豐富的技術(shù)人員根據(jù)用戶的偏好(電話或電子郵件)進(jìn)行響應(yīng),提供支持。
6、遠(yuǎn)程運(yùn)行及云數(shù)據(jù)管理
借助于云平臺(tái),QuantStutio 7 Pro可以直接從移動(dòng)設(shè)備遠(yuǎn)程設(shè)置實(shí)驗(yàn)、控制儀器運(yùn)行(QuantStudio 6 Flex只能通過(guò)電腦聯(lián)機(jī)接入云平臺(tái))。
用戶不僅可隨時(shí)隨地訪問(wèn)、存儲(chǔ)和在線數(shù)據(jù)共享。還可以基于web瀏覽器的分析模塊工具軟件,進(jìn)行包括相對(duì)定量、標(biāo)準(zhǔn)曲線、高分辨率熔體(HRM)、基因分型和存在/缺失等在內(nèi)的多種qPCR分析。
7、FDA 21 CFR Part 11合規(guī)管理功能
儀器軟件內(nèi)含安全、審計(jì)、電子簽名套件,符合美國(guó)聯(lián)邦法規(guī)第21 章第11節(jié)法規(guī)(21 CFR Part 11) 的特定要求。可自動(dòng)記錄系統(tǒng)上的所有操作,即對(duì)用戶登入、用戶專屬的默認(rèn)程序設(shè)定、操作進(jìn)行監(jiān)管并記錄,用戶僅能執(zhí)行特定功能,所有實(shí)驗(yàn)流程都依管理者設(shè)定進(jìn)行。
8、自動(dòng)化兼容性
其他實(shí)驗(yàn)室自動(dòng)化系統(tǒng)集成,實(shí)現(xiàn)全天候自動(dòng)板加載自動(dòng)化,提高生產(chǎn)率并減少手動(dòng)任務(wù)。
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