品牌: biomics
公司: 百奧邁科生物技術有限公司
提供商: Biomics Biotech 服務名稱: sgRNA活性檢測
產品詳情請聯系金山科研平臺微信:jinshanbio Biomics提供多種sgRNA活性檢測方法,包括SSA luciferase報告系統、Surveyor法、Q-PCR、突變點基因測序等SSA檢測:根據客戶要求檢測sgRNA的活性及敲除效率,客戶也可以選購我公司Precut pSG-target Cloning kit自行構建報告載體用于檢測,我公司提供陽性及陰性sgRNA及其SSA report target質粒。檢測原理:SSA報告質粒(pSG-target)中luciferase基因被終止密碼子提前終止,這種截短的luciferase沒有活性。為檢測sgRNA的剪切活性,將Cas9/sgRNA的靶點序列插入到終止密碼子之后。在Cas9和sgRNA的作用下,靶點位置的序列被有效剪切形成DSB,細胞通過同源重組重新形成有活性的luciferase(Figure 1),通過檢測luciferase的活性升高就可以反應Cas9/sgRNA的剪切活性(Figure 2)
Figure 2. Restore disrupted luciferase function via sgRNA-mediated homologous recombinationFigure 3.Increased FL/RL ratio in Cas9/sgRNA transfection cells.
Surveyor法及測序驗證:
CRISPR/Cas9打靶基因后引入的突變的方式與ZFN、TALEN基本一致,都是NHEJ或是HR。因此在CRISPR/Cas9的應用中,活性檢測或是突變效率的檢測可以參照ZFN和TALEN方法.主要包括有:靶位點直接PCR后TA克隆測序和基于可以識別錯配雙鏈的錯配內切酶檢測法(Surveyor法)。 Surveyor法即錯配酶法:靶序列經CAS/sgRNA切割后由于缺乏修復模板,將主要以非同源重組的方式進行修復,或多或少會插入或刪除一些堿基。因此將靶序列PCR擴增后經變性、退火,將形成錯配。錯配酶(主要是CEL1或T7E1酶)將識別錯配的雜合雙鏈并剪切。產物跑電泳,比較切割條帶與未切割條帶的比例,即可反映出Cas/sgRNA的活性。
BiomicsCRISPR/Cas9相關產品:Precut pSG-target Cloning kit & SSA assayDifferent type cas9 expression plasmidCRISPR /Cas9載體T7 sgRNA MICscriptTM KIT/sgRNA synthesis productPrecut SgRNA Cloning kit & pSD-gRNA PlasmidEzOmicsTM RNA QUICK clear KIT-------一步純化RNA轉錄產物Biomics CRISPR相關服務:sgRNA序列設計sgRNA表達載體構建sgRNA體外合成全基因組sgRNA文庫的構建sgRNA活性檢測Surveyor法及測序驗證穩定表達Cas9蛋白細胞株篩選利用CRISPR系統進行基因重組donor質粒構建植物CRISPRCRISPR/Cas9技術討論群:342716231微信號:Biomics-RNAi
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